معرف‌ها، کیت‌ها و ابزارهای آنالیز سلامت سلولی شاخص‌های عمومی و اختصاصی قدرت کشت سلولی را اندازه‌گیری می‌کنند. سنجش زنده ماندن ممکن است به عنوان یک معیار کلی برای سلامت سلول، یا برای ارزیابی اثرات درمان همراه با سنجش سمیت سلولی استفاده شود. سنجش تکثیر اغلب از سنتز DNA و تقسیم سلولی به عنوان معیاری برای فعالیت متابولیک سلول ها در نتیجه شرایط یا درمان استفاده می کند. کیت های سمیت سلولی می توانند از بازخوانی های کاهش زیستی برای ارزیابی فعالیت متابولیک استفاده کنند. آلودگی کشت یکی از رایج ترین موانع کشت سلولی کارآمد و قابل اعتماد است. اگرچه برخی از آلاینده ها را می توان با بازرسی میکروسکوپی وجدانی کشت ها شناسایی کرد، آلاینده هایی مانند مایکوپلاسما از روش های تشخیص بصری طفره می روند. بنابراین فرهنگ ها باید به طور معمول با استفاده از کیت ها و معرف هایی که به طور قابل اعتماد آلاینده های میکروبی را شناسایی می کنند، غربالگری شوند. معرف هایی که آلودگی را در صورت بروز به حداقل رسانده و از بین می برند، ملزومات اتاق کشت هستند که تکنیک استریل و روش های خوب اتاق کشت را تقویت می کنند.